Estudió en la Escuela de Arquitectura de Barcelona y obtuvo el título de arquitecto en 1906.
Las obras de los inicios de este autor muestran la influencia del arquitecto A. Gaudí, aunque nunca colaboró directamente con él, sino que lo conoció gracias a los contactos que mantenía con la Congregación Mariana y la Academia Catalanista y por su participación en los cursos de la parroquia del templo de la Sagrada Familia. Las obras de la primera etapa, por tanto, siguen los postulados de A. Gaudí y también de J. Puig i Cadafalch, sus maestros.
Rafael Masó es, junto con J.M. Pericas, un arquitecto que se encuentra a caballo entre el Modernismo y el Novecentismo. Sobre los años veinte del siglo XX, su trayectoria arquitectónica evolucionó hacia un lenguaje muy influido por la arquitectura centroeuropea y la Secession -que conoció a raíz de un viaje en 1912- y la nueva corriente estética novecentista, como muestra la Casa Masramon (1913-1914; Joaquim Vayreda, 6, Olot).
Su obra se encuentra principalmente en Gerona ciudad y alrededores. En lo que se refiere a la producción vinculada al Modernismo, destaca la Farinera Teixidor (1910-1911; carretera de la Santa Església, Gerona), donde se percibe la influencia gaudiniana, así como la asimilación de nuevos elementos estéticos. Su trayectoria está muy ligada a la de J.M. Pericas, arquitecto también de la segunda generación del Modernismo con quien ganó el concurso para construir la Clínica Mental de Santa Coloma de Gramanet (1923-24), pese a que las obras no se realizaron siguiendo este proyecto.
En sus edificios utilizaba con frecuencia la cerámica como elemento decorativo y como revestimiento de los elementos constructivos. En 1911 fundó con los hermanos Coromines la fábrica de cerámica La Gabarra, que estuvo en funcionamiento hasta 1919. Unos años más tarde, en 1924, fundó, junto con el escultor Fidel Aguilar i Marcó, una fábrica de argerata en Quart.