Fils d'une famille aisée, avant d'entamer ses études d'architecte, il étudie la peinture avec le peintre Simó Gòmez et à l'École de la Llotja de Barcelone, activité dont il ne reste rien. Il obtient ensuite son diplôme à l'École d'Architecture de Barcelone, profession pour laquelle on le connaît.
Après des débuts caractérisés par l'éclectisme, il passe au Modernisme entre 1900 et 1910. Plus tard, il cultivera à un style davantage classique.
Ses premiers pas d'architecte, il les fait en tant qu'assistant de F. Villar i Carmona, avec des oeuvres de type religieux: réforme de la chapelle de Sant Josep de la basilique de Montserrat et travaux de l'autel de l'église de Monistrol, aujourd'hui disparu. Tout au long de sa carrière, il conçoit divers bâtiments religieux, la plupart gracieusement, en collaboration avec Dorotea de Chopitea. Pour exemple, citons le temple du Sagrat Cor de Jesús (1902; Carretera de Vallvidrera al Tibidabo, 111-117), que son fils, Josep Maria Sagnier Vidal, lui aussi architecte, terminera.
Ses principaux clients, toutefois, seront des membres de la bourgeoisie; pour eux, il construira de nombreux logements, surtout dans l'Eixample de Barcelone: par exemple la maison d'Enric Victorià de la Riva (1897; Ali Bei, 1), qu'il adapte aux nouveautés du Modernisme: escaliers reliés aux cours centraux.
Il collabore avec l'architecte J. Domènech i Estapà pour le Palais de Justice de Barcelone (1887-1908; Passeig de Lluís Companys, 14) et avec l'ingénieur Pere Garcia i Fària pour les Nouvelles Douanes (1896-1902; Passeig de Josep Carner, 27 - 29). On trouve aussi des constructions signées de son nom dans le quartier de Ciutat Vella, à Barcelone, comme la Casa Dr. Genové (1911; Rambla, 77).
Durant la dernière partie de sa carrière, il est nommé architecte du Diocèse de Barcelone, fonctions qui lui vaudront d'obtenir le titre pontifical de marquis de Sagnier, puis, en 1928, d'être admis dans l'entourage de Sa Sainteté, avec les fonctions de «camériste secret de cape et d'épée».
Il entrera à l'Académie des Beaux-arts de Sant Jordi et sera le seul architecte trois fois lauréat du prix annuel remis par la municipalité de Barcelone au meilleur bâtiment. Occasionnellement, il fera de la politique et sera élu député.
Son oeuvre s'étend à Cuba, au Mexique et à l'Australie.